Riboxom có ở đâu

Ribosome ([1]) Chúng tôi máy đại phân tử, được tìm thấy trong tất cả sinh vật sống tế bào, thực hiện tổng hợp protein sinh học (bản dịch mRNA). Liên kết Ribôxôm axit amin cùng nhau theo thứ tự được chỉ định bởi codon của RNA thông tin (mRNA) phân tử để hình thành polypeptide dây chuyền. Ribosome bao gồm hai thành phần chính: tiểu đơn vị nhỏ và lớn của ribosome. Mỗi đơn vị con bao gồm một hoặc nhiều RNA ribosome (rRNA) phân tử và nhiều protein ribosome (RP hoặc r-protein).[2][3][4] Các ribosome và các phân tử liên kết còn được gọi là bộ máy phiên dịch.

Tổng quat

Trình tự của DNA mã hóa trình tự axit amin trong protein, được phiên mã thành chuỗi ARN thông tin. Ribosome liên kết với RNA thông tin và sử dụng trình tự của nó để xác định trình tự chính xác của các axit amin để tạo ra một protein nhất định. Các axit amin được chọn lọc và mang đến ribosome bằng cách chuyển RNA (tRNA) phân tử, đi vào ribosome và liên kết với chuỗi RNA thông tin thông qua một chống codon vòng cuống. Đối với mỗi bộ ba mã hóa (codon) trong RNA thông tin, có một RNA vận chuyển khớp và mang axit amin chính xác để kết hợp vào polypeptide chuỗi. Khi protein được sản xuất, nó có thể gập lại để tạo ra một cấu trúc ba chiều chức năng.

Một ribosome được tạo ra từ phức hợp RNA và protein và do đó là phức hợp ribonucleoprotein. Mỗi ribosome bao gồm các thành phần nhỏ (30S) và lớn (50S) được gọi là các tiểu đơn vị liên kết với nhau:

  1. (30S) chủ yếu có chức năng giải mã và cũng liên kết với mRNA
  2. (50S) chủ yếu có chức năng xúc tác; và cũng liên kết với các tRNA được aminoacyl hóa.

Quá trình tổng hợp protein từ các khối xây dựng của chúng diễn ra trong 4 giai đoạn: bắt đầu, kéo dài, kết thúc và tái chế. Mã hóa bắt đầu trong tất cả các phân tử mRNA có trình tự AUG. Mã số dừng là một trong UAA, UAG hoặc UGA; không có phân tử tRNA nào nhận ra các codon này nên ribosome nhận ra rằng quá trình dịch mã đã hoàn tất.[5] Khi ribosome đọc xong một phân tử mRNA, hai tiểu đơn vị sẽ tách ra và thường được chia nhỏ nhưng có thể được sử dụng lại. Ribosome là ribozyme, bởi vì xúc tác peptidyl transferase hoạt động liên kết các axit amin với nhau được thực hiện bởi ARN ribosom. Ribosome thường liên kết với các màng nội bào tạo nên lưới nội tiết thô.

Ribosome từ vi khuẩn, archaea và sinh vật nhân chuẩn bên trong hệ thống ba miền giống nhau ở một mức độ đáng chú ý, bằng chứng về một nguồn gốc chung. Chúng khác nhau về kích thước, trình tự, cấu trúc và tỷ lệ protein trên RNA. Sự khác biệt trong cấu trúc cho phép một số thuốc kháng sinh để tiêu diệt vi khuẩn bằng cách ức chế ribosome của chúng, đồng thời để ribosome của con người không bị ảnh hưởng. Ở tất cả các loài, nhiều hơn một ribosome có thể di chuyển dọc theo một chuỗi mRNA duy nhất cùng một lúc (như một polysome), mỗi "đọc" một trình tự cụ thể và tạo ra một phân tử protein tương ứng.

Các ribosome ty thể của tế bào nhân thực về mặt chức năng giống với nhiều đặc điểm của tế bào ở vi khuẩn, phản ánh nguồn gốc tiến hóa có thể có của ti thể.[6][7]

Khám phá

Ribosome lần đầu tiên được quan sát thấy vào giữa những năm 1950 bởi Người Mỹ gốc Romania nhà sinh học tế bào George Emil Palade, sử dụng một kính hiển vi điện tử, dưới dạng hạt hoặc hạt dày đặc.[8] Thuật ngữ "ribosome" được đề xuất bởi nhà khoa học Richard B. Roberts vào cuối những năm 1950:

Trong suốt quá trình của hội nghị chuyên đề, một khó khăn về ngữ nghĩa đã trở nên rõ ràng. Đối với một số người tham gia, "microsome" có nghĩa là các hạt ribonucleoprotein của phần microsome bị ô nhiễm bởi vật liệu protein và lipid khác; đối với những người khác, các microsome bao gồm protein và lipid bị ô nhiễm bởi các hạt. Cụm từ "các hạt microsome" có vẻ không phù hợp và "các hạt ribonucleoprotein của phần microsome" là quá khó hiểu. Trong cuộc họp, từ "ribosome" đã được gợi ý, một cái tên rất ưng ý và âm thanh vui tai. Sự nhầm lẫn hiện nay sẽ được loại bỏ nếu "ribosome" được sử dụng để chỉ định các hạt ribonucleoprotein có kích thước từ 35 đến 100S.

— Albert, các hạt vi mô và tổng hợp protein[9]

Albert Claude, Christian de Duvevà George Emil Palade cùng được trao giải Giải Nobel Sinh lý học hoặc Y học, vào năm 1974, để phát hiện ra ribosome.[10] Các giải thưởng Nobel trong Hóa học 2009 được trao cho Venkatraman Ramakrishnan, Thomas A. Steitz và Ada E. Yonath để xác định cấu trúc chi tiết và cơ chế của ribosome.[11]

Kết cấu

Riboxom có ở đâu

Thành phần rRNA của ribosome cho rRNA của sinh vật nhân sơ và sinh vật nhân chuẩn

Riboxom có ở đâu

Hình 2: Đơn vị con lớn (đỏ) và nhỏ (xanh) phù hợp với nhau.

Ribosome là một cỗ máy tế bào rất phức tạp. Nó phần lớn được tạo thành từ RNA chuyên dụng được gọi là RNA ribosome (rRNA) cũng như hàng chục protein riêng biệt (số lượng chính xác khác nhau một chút giữa các loài). Các protein và rRNA của ribosome được sắp xếp thành hai phần ribosome riêng biệt có kích thước khác nhau, thường được gọi là tiểu đơn vị lớn và nhỏ của ribosome. Ribosome bao gồm hai tiểu đơn vị phù hợp với nhau (Hình 2) và hoạt động như một để dịch mRNA thành chuỗi polypeptide trong quá trình tổng hợp protein (Hình 1). Vì chúng được hình thành từ hai tiểu đơn vị có kích thước không bằng nhau, nên chúng có trục hơi dài hơn đường kính.

Ribosome của vi khuẩn

Ribôxôm nhân sơ có khoảng 20nm (200 Å) có đường kính và bao gồm 65% rRNA và 35% protein ribosome.[12] Ribôxôm ở sinh vật nhân thực có kích thước từ 25 đến 30 nm Đường kính (250–300 diameter) với tỷ lệ rRNA trên protein gần bằng 1.[13] Tinh thể học công việc [14] đã chỉ ra rằng không có protein ribosom nào gần vị trí phản ứng để tổng hợp polypeptit. Điều này cho thấy rằng các thành phần protein của ribosome không tham gia trực tiếp vào xúc tác hình thành liên kết peptit, mà là các protein này hoạt động như một giá đỡ có thể nâng cao khả năng tổng hợp protein của rRNA (Xem: Ribozyme).

Riboxom có ở đâu

Hình 3: Cấu trúc nguyên tử của tiểu đơn vị 30S từ Thermus thermophilus.[15] Protein có màu xanh lam và chuỗi RNA đơn có màu nâu.

Các tiểu đơn vị ribosom của vi khuẩn và sinh vật nhân thực khá giống nhau.[16]

Đơn vị đo lường được sử dụng để mô tả các tiểu đơn vị của ribosom và các đoạn rRNA là Svedberg đơn vị đo tỷ lệ sự lắng đọng trong ly tâm hơn là kích thước. Điều này giải thích tại sao các tên đoạn không cộng lại với nhau: ví dụ, ribosome 70S của vi khuẩn được tạo ra từ các tiểu đơn vị 50S và 30S.

Vi khuẩn có 70S ribosome, mỗi ribosome bao gồm một nhỏ (30S) và lớn (50S) đơn vị con. E coli, ví dụ, có một 16S Tiểu đơn vị RNA (bao gồm 1540 nucleotide) được liên kết với 21 protein. Đơn vị con lớn bao gồm một 5S Tiểu đơn vị RNA (120 nucleotide), một tiểu đơn vị RNA 23S (2900 nucleotide) và 31 protein.[16]

Ribosome của E coli (một loại vi khuẩn)[17]:962
ribosomeđơn vị conrARNr-protein
70S50S23S (2904 nt)31
5S (120 nt)
30S16S (1542 nt)21

Nhãn sở thích cho các vị trí liên kết tRNA trên E coli ribosome cho phép xác định các protein vị trí A và P rất có thể liên quan đến hoạt động peptidyltransferase; các protein có nhãn là L27, L14, L15, L16, L2; ít nhất L27 được đặt tại địa điểm của nhà tài trợ, như được chỉ ra bởi E. Collatz và A.P. Czernilofsky.[18][19] Nghiên cứu bổ sung đã chứng minh rằng các protein S1 và S21, kết hợp với đầu 3 của RNA ribosome 16S, tham gia vào quá trình bắt đầu dịch mã.[20]

Ribôxôm nhân chuẩn

Sinh vật nhân chuẩn có 80S ribosome nằm trong tế bào của chúng, mỗi loại bao gồm một nhỏ (40S) và đơn vị con lớn (60S). Đơn vị con 40S của họ có RNA 18S (1900 nucleotit) và 33 prôtêin.[21][22] Đơn vị con lớn bao gồm một RNA 5S (120 nucleotide), RNA 28S (4700 nucleotide), a 5,8S RNA (160 nucleotide) tiểu đơn vị và 46 protein.[16][21][23]

ribosome tế bào nhân thực (R. norvegicus)[17]:65
ribosomeđơn vị conrRNAr-protein
80S60S28S (4718 nt)49
5,8S (160 nt)
5S (120 nt)
40S18S (1874 nt)33

Trong năm 1977, Czernilofsky công bố nghiên cứu sử dụng dán nhãn mối quan hệ để xác định các vị trí gắn kết tRNA trên ribosome gan chuột. Một số protein, bao gồm L32 / 33, L36, L21, L23, L28 / 29 và L13 được cho là đang ở hoặc gần peptidyl transferase trung tâm.[24]

Plastoribosome và mitoribosome

Ở sinh vật nhân thực, ribosome có trong ty thể (đôi khi được gọi là mitoribosome) và trong plastids nhu la lục lạp (còn được gọi là plastoribosome). Chúng cũng bao gồm các đơn vị con lớn và nhỏ được liên kết với nhau bằng protein thành một hạt 70S.[16] Những ribosome này tương tự như của vi khuẩn và những bào quan này được cho là có nguồn gốc như cộng sinh vi khuẩn[16] Trong số hai, ribosome lục lạp gần với vi khuẩn hơn là ribochrondrial. Nhiều đoạn ARN ribosom trong tiểu phân bị rút ngắn, và trong trường hợp 5S rRNA, được thay thế bởi các cấu trúc khác ở động vật và nấm.[25] Đặc biệt, Leishmania tarentolae có một bộ rRNA ty thể tối giản.[26]

Các cryptomonad và chlorarachniophyte tảo có thể chứa một nucleomorph giống như một nhân tế bào nhân thực tiền đình.[27] Các ribosome 80S của sinh vật nhân chuẩn có thể có trong ngăn chứa nucleomorph.[cần trích dẫn]

Tận dụng sự khác biệt

Sự khác biệt giữa ribosome của vi khuẩn và sinh vật nhân thực được khai thác bởi nhà hóa dược để tạo ra thuốc kháng sinh có thể tiêu diệt ổ nhiễm vi khuẩn mà không gây hại cho các tế bào của người bị nhiễm. Do sự khác biệt trong cấu trúc của chúng, các ribosome 70S của vi khuẩn dễ bị tổn thương bởi các kháng sinh này trong khi ribosome 80S của sinh vật nhân thực thì không.[28] Mặc dù ty thể sở hữu ribosome tương tự như ở vi khuẩn, ty thể không bị ảnh hưởng bởi các kháng sinh này vì chúng được bao quanh bởi một màng kép không dễ dàng tiếp nhận các kháng sinh này vào bào quan.[29] Tuy nhiên, một ví dụ đáng chú ý bao gồm kháng sinh chống ung thư chloramphenicol, ức chế thành công các ribosome 50S của vi khuẩn và 50S của ty thể.[30] Điều tương tự của ti thể không thể nói đến lục lạp, nơi mà khả năng kháng kháng sinh trong protein ribosome là một đặc điểm được đưa vào như một dấu hiệu trong kỹ thuật di truyền.[31]

Tài sản chung

Các ribosome khác nhau có chung cấu trúc lõi, cấu trúc này khá giống nhau mặc dù có sự khác biệt lớn về kích thước. Phần lớn RNA được tổ chức cao thành nhiều loại mô típ cấu trúc bậc ba, ví dụ pseudoknots triển lãm đó xếp chồng đồng trục. Bổ sung RNA trong các ribosome lớn hơn là trong một số lần chèn dài liên tục [32], sao cho chúng tạo thành các vòng ngoài cấu trúc cốt lõi mà không làm gián đoạn hoặc thay đổi nó.[16] Tất cả các hoạt động xúc tác của ribosome được thực hiện bởi RNA; các protein nằm trên bề mặt và dường như ổn định cấu trúc.[16]

Cấu trúc độ phân giải cao

Riboxom có ở đâu

Hinh 4: Cấu trúc nguyên tử của tiểu đơn vị 50S từ Haloarcula marismortui. Protein có màu xanh lam và hai chuỗi RNA có màu nâu và vàng.[33] Phần nhỏ màu xanh lá cây ở trung tâm của đơn vị con là vị trí đang hoạt động.

Cấu trúc phân tử chung của ribosome đã được biết đến từ đầu những năm 1970. Vào đầu những năm 2000, cấu trúc đã đạt được ở độ phân giải cao, theo thứ tự của một số ångströms.

Các bài báo đầu tiên đưa ra cấu trúc của ribosome ở độ phân giải nguyên tử đã được công bố gần như đồng thời vào cuối năm 2000. Tiểu đơn vị 50S (sinh vật nhân sơ lớn) được xác định từ khảo cổ học Haloarcula marismortui[33] và vi khuẩn Deinococcus radiodurans,[34] và cấu trúc của tiểu đơn vị 30S được xác định từ Thermus thermophilus.[15] Các nghiên cứu cấu trúc này đã được trao giải Nobel Hóa học năm 2009. Vào tháng 5 năm 2001, các tọa độ này được sử dụng để tái tạo lại toàn bộ T. thermophilus Hạt 70S ở 5,5Å độ phân giải.[35]

Hai bài báo đã được xuất bản vào tháng 11 năm 2005 với cấu trúc của Escherichia coli Ribôxôm 70S. Cấu trúc của một ribosome bị bỏ trống được xác định ở 3,5Å độ phân giải sử dụng Tinh thể học tia X.[36] Sau đó, hai tuần sau, một cấu trúc dựa trên cryo-kính hiển vi điện tử được xuất bản, công bố,[37] mô tả ribosome lúc 11–15Å phân giải trong hành động truyền một sợi protein mới được tổng hợp vào kênh dẫn protein.

Các cấu trúc nguyên tử đầu tiên của ribosome phức tạp với tRNA và mRNA phân tử đã được giải quyết bằng cách sử dụng tinh thể học tia X của hai nhóm độc lập, ở 2,8Å[38] và ở mức 3,7Å.[39] Các cấu trúc này cho phép người ta xem chi tiết về các tương tác của Thermus thermophilus ribosome với mRNA và với tRNA bị ràng buộc tại các vị trí ribosom cổ điển. Tương tác của ribosome với mRNA dài có chứa Trình tự Shine-Dalgarno được hiển thị ngay sau đó ở mức 4,5–5,5Å độ phân giải.[40]

Năm 2011, cấu trúc nguyên tử hoàn chỉnh đầu tiên của ribosome 80S sinh vật nhân thực từ nấm men Saccharomyces cerevisiae thu được bằng phương pháp tinh thể học.[21] Mô hình tiết lộ kiến ​​trúc của các phần tử dành riêng cho eukaryote và sự tương tác của chúng với lõi được bảo tồn phổ biến. Đồng thời, mô hình hoàn chỉnh của cấu trúc ribosome 40S ở sinh vật nhân thực ở Tetrahymena thermophila đã được xuất bản và mô tả cấu trúc của Đơn vị con 40S, cũng như nhiều thông tin về sự tương tác của tiểu đơn vị 40S với eIF1 suốt trong bắt đầu dịch.[22] Tương tự như vậy, sinh vật nhân chuẩn Đơn vị con 60S cấu trúc cũng được xác định từ Tetrahymena thermophila phức tạp với eIF6.[23]

Chức năng

Ribosome là các hạt nhỏ bao gồm RNA và các protein liên kết có chức năng tổng hợp protein. Protein cần thiết cho nhiều chức năng của tế bào như sửa chữa hư hỏng hoặc chỉ đạo các quá trình hóa học. Ribosome có thể được tìm thấy trôi nổi trong tế bào chất hoặc gắn vào lưới nội chất. Về cơ bản, chức năng chính của chúng là chuyển đổi mã di truyền thành trình tự axit amin và xây dựng các polyme protein từ các đơn phân axit amin.

Ribosome đóng vai trò như chất xúc tác trong hai quá trình sinh học cực kỳ quan trọng được gọi là chuyển peptidyl và thủy phân peptidyl.[41] "Trung tâm PT chịu trách nhiệm sản xuất liên kết protein trong quá trình kéo dài protein".[41]

Dịch

Ribosome là nơi làm việc của sinh tổng hợp protein, quá trình dịch mRNA thành chất đạm. MRNA bao gồm một loạt codon được giải mã bởi ribosome để tạo ra protein. Sử dụng mRNA làm khuôn mẫu, ribosome đi ngang qua từng codon (3 nucleotide) của mRNA, bắt cặp nó với axit amin thích hợp được cung cấp bởi aminoacyl-tRNA. Aminoacyl-tRNA chứa phần bổ sung đối kháng ở một đầu và axit amin thích hợp ở đầu kia. Để nhận dạng nhanh chóng và chính xác tRNA thích hợp, ribosome sử dụng những thay đổi cấu trúc lớn (hiệu đính tuân thủ).[42] Tiểu đơn vị nhỏ của ribosom, thường được liên kết với aminoacyl-tRNA chứa axit amin đầu tiên methionine, liên kết với codon AUG trên mRNA và thu nhận tiểu đơn vị lớn của ribosom. Ribosome chứa ba vị trí liên kết RNA, được chỉ định là A, P và E. A-site liên kết với một aminoacyl-tRNA hoặc các yếu tố giải phóng kết thúc;[43][44] các P-site liên kết với một peptidyl-tRNA (một tRNA liên kết với chuỗi poly-peptide); và Trang điện tử (thoát ra) liên kết với một tRNA tự do. Quá trình tổng hợp protein bắt đầu từ bắt đầu codon AUG gần đầu 5 'của mRNA. mRNA liên kết với vị trí P của ribosome trước. Ribosome nhận ra codon bắt đầu bằng cách sử dụng Chuỗi Shine-Dalgarno của mRNA ở sinh vật nhân sơ và Hộp Kozak ở sinh vật nhân thực.

Mặc dù xúc tác của liên kết peptit liên quan đến C2 hydroxyl của vị trí P của RNA adenosine trong cơ chế con thoi proton, các bước khác trong quá trình tổng hợp protein (chẳng hạn như chuyển vị) là do những thay đổi trong cấu trúc protein. Kể từ khi họ lõi xúc tác được làm bằng RNA, ribosome được phân loại là "ribozyme,"[45] và người ta cho rằng chúng có thể là tàn tích của Thế giới RNA.[46]

Riboxom có ở đâu

Hình 5: Bản dịch mRNA (1) bởi ribosome (2) (được hiển thị dưới dạng nhỏlớn đơn vị con) thành một chuỗi polypeptit (3). Ribosome bắt đầu từ codon bắt đầu của RNA (AUG) và kết thúc ở mã số dừng (UAG).

Trong Hình 5, cả hai tiểu đơn vị của ribosome (nhỏlớn) lắp ráp ở codon bắt đầu (về cuối 5 'của mRNA). Công dụng của ribosome tRNA khớp với codon hiện tại (bộ ba) trên mRNA để nối axit amin đến chuỗi polypeptit. Điều này được thực hiện đối với mỗi bộ ba trên mRNA, trong khi ribosome di chuyển về phía cuối 3 'của mRNA. Thông thường trong tế bào vi khuẩn, một số ribosome đang hoạt động song song trên một mRNA duy nhất, tạo thành cái được gọi là polyribosome hoặc là polysome.

Gấp giao dịch

Ribosome được biết là tham gia tích cực vào gấp protein.[47][48] Các cấu trúc thu được theo cách này thường giống với cấu trúc thu được trong quá trình phản ứng hóa học protein, tuy nhiên, các con đường dẫn đến sản phẩm cuối cùng có thể khác.[49][50] Trong một số trường hợp, ribosome đóng vai trò quan trọng trong việc thu nhận dạng protein chức năng. Ví dụ, một trong những cơ chế có thể có của việc gấp protein thắt nút dựa vào ribosome đẩy chuỗi qua vòng đính kèm.[51]

Bổ sung các axit amin không phụ thuộc vào dịch mã

Sự hiện diện của protein kiểm soát chất lượng ribosome Rqc2 có liên quan đến sự kéo dài protein không phụ thuộc vào mRNA.[52][53] Sự kéo dài này là kết quả của sự bổ sung ribosome (thông qua tRNA do Rqc2 mang lại) của CON MÈO đuôi: ribosome mở rộng C-terminus của một protein bị ngưng trệ với các trình tự ngẫu nhiên, không phụ thuộc vào dịch mã của alanines và threonines.[54][55]

Vị trí ribosome

Ribosome được phân loại là "tự do" hoặc "liên kết màng".

Riboxom có ở đâu

Hình 6: Ribosome dịch một protein được tiết vào lưới nội chất.

Các ribosome tự do và liên kết màng chỉ khác nhau về sự phân bố trong không gian của chúng; chúng giống nhau về cấu trúc. Việc ribosome tồn tại ở trạng thái tự do hay liên kết màng phụ thuộc vào sự hiện diện của Chuỗi tín hiệu nhắm mục tiêu ER trên protein đang được tổng hợp, vì vậy một ribosome riêng lẻ có thể được liên kết màng khi nó tạo ra một protein, nhưng tự do trong tế bào khi nó tạo ra một protein khác.

Ribosome đôi khi được gọi là bào quan, nhưng việc sử dụng thuật ngữ bào quan thường bị hạn chế trong việc mô tả các thành phần phụ của tế bào bao gồm màng phospholipid, mà ribosome, hoàn toàn là hạt, thì không. Vì lý do này, đôi khi ribosome có thể được mô tả là "bào quan không màng".

Ribôxôm tự do

Các ribosome tự do có thể di chuyển đến bất kỳ đâu trong dịch bào, nhưng bị loại trừ khỏi nhân tế bào và các bào quan khác. Protein được hình thành từ các ribosome tự do được giải phóng vào tế bào và được sử dụng trong tế bào. Vì dịch bào chứa nồng độ cao của glutathione và do đó, giảm môi trường, protein chứa liên kết disulfua, được hình thành từ dư lượng cysteine ​​bị oxy hóa, không thể được tạo ra bên trong nó.

Ribôxôm liên kết màng

Khi một ribosome bắt đầu tổng hợp protein cần thiết trong một số bào quan, ribosome tạo ra protein này có thể trở thành "màng liên kết". Ở tế bào nhân thực, điều này xảy ra trong một vùng của lưới nội chất (ER) được gọi là "ER thô". Các chuỗi polypeptit mới được tạo ra được chèn trực tiếp vào ER nhờ nhiệm vụ của ribosome tổng hợp vectơ và sau đó được vận chuyển đến các điểm đến của họ, thông qua con đường bài tiết. Các ribosome liên kết thường tạo ra các protein được sử dụng trong màng sinh chất hoặc bị trục xuất khỏi tế bào qua xuất bào.[56]

Tạo sinh

Trong tế bào vi khuẩn, ribosome được tổng hợp trong tế bào chất thông qua phiên mã của nhiều gen ribosome operon. Ở sinh vật nhân thực, quá trình này diễn ra cả trong tế bào chất và trong nucleolus, là một khu vực trong nhân tế bào. Quá trình lắp ráp liên quan đến chức năng phối hợp của hơn 200 protein trong quá trình tổng hợp và xử lý bốn rRNA, cũng như lắp ráp các rRNA đó với các protein ribosome.

Gốc

Ribosome có thể có nguồn gốc đầu tiên trong một Thế giới RNA, xuất hiện như một phức hợp tự sao chép mà sau này chỉ phát triển khả năng tổng hợp protein khi axit amin bắt đầu xuất hiện.[57] Các nghiên cứu cho rằng các ribosome cổ đại chỉ được cấu tạo từ rRNA có thể đã phát triển khả năng tổng hợp liên kết peptit.[58][59][60] Ngoài ra, bằng chứng chỉ ra rõ ràng các ribosome cổ đại là các phức hợp tự sao chép, trong đó rRNA trong ribosome có các mục đích thông tin, cấu trúc và xúc tác vì nó có thể được mã hóa cho tRNA và các protein cần thiết cho quá trình tự sao chép của ribosome.[61] Các sinh vật tế bào giả thuyết có RNA tự sao chép nhưng không có DNA được gọi là ribocyte (hay ribocells).[62][63]

Khi các axit amin dần dần xuất hiện trong thế giới RNA trong điều kiện tiền sinh học,[64][65] tương tác của chúng với RNA xúc tác sẽ làm tăng cả phạm vi và hiệu quả hoạt động của các phân tử RNA xúc tác.[57] Do đó, động lực cho sự tiến hóa của ribosome từ thời cổ đại máy tự tái tạo ở dạng hiện tại như một máy dịch mã có thể là áp lực chọn lọc để kết hợp các protein vào cơ chế tự sao chép của ribosome, để tăng khả năng tự sao chép của nó.[61][66][67]

Ribosome không đồng nhất

Ribosome không đồng nhất về mặt cấu tạo giữa các loài và ngay cả trong cùng một tế bào, bằng chứng là sự tồn tại của ribosome tế bào chất và ti thể trong cùng các tế bào nhân thực. Một số nhà nghiên cứu đã gợi ý rằng sự không đồng nhất trong thành phần của protein ribosom ở động vật có vú là rất quan trọng để điều chỉnh gen, I E., giả thuyết ribosome chuyên biệt.[68][69] Tuy nhiên, giả thuyết này đang gây tranh cãi và là chủ đề của các nghiên cứu đang tiếp tục.[70][71]

Sự không đồng nhất trong thành phần ribosome lần đầu tiên được đề xuất liên quan đến việc kiểm soát dịch mã tổng hợp protein bởi Vince Mauro và Gerald Edelman.[72] Họ đề xuất giả thuyết bộ lọc ribosome để giải thích các chức năng điều hòa của ribosome. Bằng chứng cho thấy rằng các ribosome chuyên biệt dành riêng cho các quần thể tế bào khác nhau có thể ảnh hưởng đến cách gen được dịch mã.[73] Một số protein ribosome trao đổi từ phức hợp được lắp ráp với bào tương bản sao [74] gợi ý rằng cấu trúc của in vivo ribosome có thể được sửa đổi mà không cần tổng hợp toàn bộ ribosome mới.

Một số protein ribosome là hoàn toàn quan trọng đối với sự sống của tế bào trong khi những protein khác thì không. Trong men chớm nở14/78 protein ribosome không cần thiết cho sự phát triển, trong khi ở người, điều này phụ thuộc vào tế bào nghiên cứu.[75] Các dạng không đồng nhất khác bao gồm các biến đổi sau dịch mã đối với protein ribosome như acetyl hóa, methyl hóa và phosphoryl hóa.[76] Arabidopsis,[77][78][79][80] Lan tỏa các vị trí xâm nhập ribosome bên trong (IRESs) có thể làm trung gian cho quá trình dịch mã bởi các ribosome riêng biệt về mặt thành phần.   Ví dụ, các đơn vị ribosome 40S không có eS25 trong nấm men và tế bào động vật có vú không thể tuyển dụng CrPV IGR IRES.[81]

Sự không đồng nhất của các sửa đổi RNA ribosome đóng một vai trò quan trọng trong việc duy trì cấu trúc và / hoặc chức năng và hầu hết các sửa đổi mRNA được tìm thấy ở các vùng được bảo tồn cao.[82][83] Các sửa đổi rRNA phổ biến nhất là pseudouridylation và 2’-O metyl hóa của ribose.[84]

Xem thêm

Người giới thiệu

  1. ^ Jones D, Hartman J, Roach P, Setter J (2003) [1917]. Từ điển phát âm tiếng Anh. Cambridge: Nhà xuất bản Đại học Cambridge. ISBN 978-3-12-539683-8.
  2. ^ Konikkat S (tháng 2 năm 2016). Các sự kiện sửa đổi động cơ thúc đẩy việc loại bỏ trình tự khoảng cách ITS2 trong quá trình lắp ráp các tiểu đơn vị Ribosome 60S ở S. cerevisiae (Luận án Tiến sĩ). Đại học Carnegie Mellon. Đã lưu trữ từ bản gốc vào ngày 3 tháng 8 năm 2017.
  3. ^ Weiler EW, Nover L (2008). Allgemeine und Molekulare Botanik (bằng tiếng Đức). Stuttgart: Georg Thieme Verlag. p. 532. ISBN 978-3-13-152791-2.
  4. ^ de la Cruz J, Karbstein K, Woolford JL (2015). "Chức năng của protein ribosome trong việc lắp ráp ribosome của sinh vật nhân chuẩn in vivo". Đánh giá hàng năm về Hóa sinh. 84: 93–129. doi:10.1146 / annurev-biochem-060614-033917. PMC 4772166. PMID 25706898.
  5. ^ "Dịch thuật tự nhiên phù hợp / bản dịch RNA".
  6. ^ Benne R, Sloof P (1987). "Sự tiến hóa của bộ máy tổng hợp protein ty thể". Hệ thống sinh học. 21 (1): 51–68. doi:10.1016/0303-2647(87)90006-2. PMID 2446672.
  7. ^ "Ribosome". Đã lưu trữ từ bản gốc vào ngày 2009-03-20. Đã lấy 2011-04-28.
  8. ^ Palade GE (tháng 1 năm 1955). "Một thành phần hạt nhỏ của tế bào chất". Tạp chí Sinh lý và Tế bào Sinh hóa. 1 (1): 59–68. doi:10.1083 / jcb.1.1.59. PMC 2223592. PMID 14381428.
  9. ^ Roberts RB, biên tập. (Năm 1958). "Giới thiệu". Hạt vi mô và tổng hợp protein. New York: Pergamon Press, Inc.
  10. ^ "Giải Nobel Sinh lý học hoặc Y học 1974". Nobelprize.org. Tổ chức Nobel. Đã lưu trữ từ bản gốc vào ngày 26 tháng 1 năm 2013. Đã lấy 10 tháng 12 2012.
  11. ^ "Giải Nobel Hóa học 2009". Tổ chức Nobel. Đã lưu trữ từ bản gốc vào ngày 28 tháng 4 năm 2012. Đã lấy 10 tháng 12 2012.
  12. ^ Kurland CG (1960). "Đặc điểm phân tử của axit ribonucleic từ các ribosome của Escherichia coli". Tạp chí Sinh học phân tử. 2 (2): 83–91. doi:10.1016 / s0022-2836 (60) 80029-0.
  13. ^ Wilson DN, Doudna Cate JH (tháng 5 năm 2012). "Cấu trúc và chức năng của ribosome nhân thực". Các quan điểm về cảng mùa xuân lạnh trong sinh học. 4 (5): a011536. doi:10.1101 / cshperspect.a011536. PMC 3331703. PMID 22550233.
  14. ^ Nissen P, Hansen J, Ban N, Moore PB, Steitz TA (tháng 8 năm 2000). “Cơ sở cấu trúc của hoạt động của ribôxôm trong tổng hợp liên kết peptit”. Khoa học. 289 (5481): 920–30. Bibcode:2000Sci ... 289..920N. doi:10.1126 / khoa học.289.5481.920. PMID 10937990.
  15. ^ a b Wimberly BT, Brodersen DE, Clemons WM, Morgan-Warren RJ, Carter AP, Vonrhein C, Hartsch T, Ramakrishnan V (tháng 9 năm 2000). "Cấu trúc của tiểu đơn vị 30S ribosom". Thiên nhiên. 407 (6802): 327–39. Bibcode:2000Natur.407..327W. doi:10.1038/35030006. PMID 11014182.
  16. ^ a b c d e f g Alberts, Bruce; et al. (Năm 2002). Sinh học phân tử của tế bào (Xuất bản lần thứ 4). Khoa học Garland. p. 342. ISBN 978-0-8153-3218-3.
  17. ^ a b Garrett R, Grisham CM (2009). Hóa sinh (Xuất bản lần thứ 4). Dịch vụ Học tập Cengage. ISBN 978-0-495-11464-2.
  18. ^ Collatz E, Küchler E, Stöffler G, Czernilofsky AP (tháng 4 năm 1976). "Vị trí phản ứng trên protein ribosome L27 với dẫn xuất nhãn ái lực của tRNA Met f". Thư FEBS. 63 (2): 283–6. doi:10.1016/0014-5793(76)80112-3. PMID 770196.
  19. ^ Czernilofsky AP, Collatz EE, Stöffler G, Kuechler E (tháng 1 năm 1974). "Protein tại các vị trí liên kết tRNA của ribosome Escherichia coli". Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 71 (1): 230–4. Bibcode:1974PNAS ... 71..230C. doi:10.1073 / pnas.71.1.230. PMC 387971. PMID 4589893.
  20. ^ Czernilofsky AP, Kurland CG, Stöffler G (tháng 10 năm 1975). "Protein ribosome 30S liên kết với đầu tận cùng 3'của RNA 16S". Thư FEBS. 58 (1): 281–4. doi:10.1016/0014-5793(75)80279-1. PMID 1225593.
  21. ^ a b c Ben-Shem A, Garreau de Loubresse N, Melnikov S, Jenner L, Yusupova G, Yusupov M (tháng 12 năm 2011). "Cấu trúc của ribosome nhân thực ở độ phân giải 3,0 Å". Khoa học. 334 (6062): 1524–9. Bibcode:2011Sci ... 334.1524B. doi:10.1126 / science.1212642. PMID 22096102.
  22. ^ a b Rabl J, Leibundgut M, Ataide SF, Haag A, Ban N (tháng 2 năm 2011). "Cấu trúc tinh thể của tiểu đơn vị ribosome 40S của sinh vật nhân chuẩn phức hợp với yếu tố khởi đầu 1" (PDF). Khoa học. 331 (6018): 730–6. Bibcode:2011Sci ... 331..730R. doi:10.1126 / science.1198308. hdl:20.500.11850/153130. PMID 21205638.
  23. ^ a b Klinge S, Voigts-Hoffmann F, Leibundgut M, Arpagaus S, Ban N (tháng 11 năm 2011). "Cấu trúc tinh thể của tiểu đơn vị ribosome 60S của sinh vật nhân chuẩn phức hợp với yếu tố khởi đầu 6". Khoa học. 334 (6058): 941–8. Bibcode:2011Sci ... 334..941K. doi:10.1126 / khoa học.1211204. PMID 22052974.
  24. ^ Fabijanski S, Pellegrini M (1977). "Xác định các protein tại vị trí liên kết peptidyl-tRNA của ribosome gan chuột". Phân tử & Di truyền chung. 184 (3): 551–6. doi:10.1007 / BF00431588. PMID 6950200.
  25. ^ Agrawal RK, Sharma MR (tháng 12 năm 2012). "Các khía cạnh cấu trúc của bộ máy dịch mã ti thể". Ý kiến ​​hiện tại trong sinh học cấu trúc. 22 (6): 797–803. doi:10.1016 / j.sbi.2012.08.003. PMC 3513651. PMID 22959417.
  26. ^ Sharma MR, Booth TM, Simpson L, Maslov DA, Agrawal RK (tháng 6 năm 2009). "Cấu trúc của ribosome ti thể với RNA tối thiểu". Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 106 (24): 9637–42. Bibcode:2009PNAS..106.9637S. doi:10.1073 / pnas.0901631106. PMC 2700991. PMID 19497863.
  27. ^ Archibald JM, Lane CE (2009). "Đi, đi, không hoàn toàn biến mất: nucleomorphs như một nghiên cứu điển hình về giảm hệ gen hạt nhân". Tạp chí Di truyền. 100 (5): 582–90. doi:10.1093 / jiled / esp055. PMID 19617523.
  28. ^ Recht MI, Douthwaite S, Puglisi JD (tháng 6 năm 1999). "Cơ sở cho tính đặc hiệu của tế bào nhân sơ đối với tác dụng của kháng sinh aminoglycoside". Tạp chí EMBO. 18 (11): 3133–8. doi:10.1093 / floatj / 18.11.3133. PMC 1171394. PMID 10357824.
  29. ^ O'Brien TW (tháng 5 năm 1971). "Sự xuất hiện chung của 55 ribosome S trong ti thể gan của động vật có vú". Tạp chí Hóa học Sinh học. 246 (10): 3409–17. PMID 4930061.
  30. ^ "Ức chế tủy xương do cloramphenicol". JAMA. 213 (7): 1183–1184. 1970-08-17. doi:10.1001 / jama.1970.03170330063011. ISSN 0098-7484.
  31. ^ Newman SM, Boynton JE, Gillham NW, Randolph-Anderson BL, Johnson AM, Harris EH (tháng 12 năm 1990). "Sự biến đổi gen RNA ribosome lục lạp ở Chlamydomonas: đặc điểm phân tử và di truyền của các sự kiện tích hợp". Di truyền học. 126 (4): 875–88. PMC 1204285. PMID 1981764.
  32. ^ Penev PI, Fakhretaha-Aval S, Patel VJ, Cannone JJ, Gutell RR, Petrov AS, Williams LD, Glass JB (tháng 8 năm 2020). "Các phân đoạn mở rộng RNA ribosome siêu lớn trong vi khuẩn Asgard". Sinh học và tiến hóa bộ gen. doi:10.1093 / gbe / evaa170. PMID 32785681.
  33. ^ a b Ban N, Nissen P, Hansen J, Moore PB, Steitz TA (tháng 8 năm 2000). "Cấu trúc nguyên tử hoàn chỉnh của tiểu đơn vị ribosom lớn ở độ phân giải 2,4 A". Khoa học. 289 (5481): 905–20. Bibcode:2000Sci ... 289..905B. CiteSeerX 10.1.1.58.2271. doi:10.1126 / khoa học.289.5481.905. PMID 10937989.
  34. ^ Schluenzen F, Tocilj A, Zarivach R, Harms J, Gluehmann M, Janell D, Bashan A, Bartels H, Agmon I, Franceschi F, Yonath A (tháng 9 năm 2000). "Cấu trúc của tiểu đơn vị ribosome nhỏ được hoạt hóa chức năng ở độ phân giải 3,3 angstrom". Ô. 102 (5): 615–23. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00084-2. PMID 11007480.
  35. ^ Yusupov MM, Yusupova GZ, Baucom A, Lieberman K, Earnest TN, Cate JH, Noller HF (tháng 5 năm 2001). "Cấu trúc tinh thể của ribosome ở độ phân giải 5,5 A". Khoa học. 292 (5518): 883–96. Bibcode:2001Sci ... 292..883Y. doi:10.1126 / khoa học.1060089. PMID 11283358.
  36. ^ Schuwirth BS, Borovinskaya MA, Hau CW, Zhang W, Vila-Sanjurjo A, Holton JM, Cate JH (11/2005). "Cấu trúc của ribosome vi khuẩn ở độ phân giải 3,5 A". Khoa học. 310 (5749): 827–34. Bibcode:2005Sci ... 310..827S. doi:10.1126 / khoa học.1117230. PMID 16272117.
  37. ^ Mitra K, Schaffitzel C, Shaikh T, Tama F, Jenni S, Brooks CL, Ban N, Frank J (tháng 11 năm 2005). "Cấu trúc của kênh dẫn protein của vi khuẩn E. coli liên kết với ribosome đang dịch mã". Thiên nhiên. 438 (7066): 318–24. Bibcode:2005Natur.438..318M. doi:10.1038 / nature04133. PMC 1351281. PMID 16292303.
  38. ^ Selmer M, Dunham CM, Murphy FV, Weixlbaumer A, Petry S, Kelley AC, Weir JR, Ramakrishnan V (tháng 9 năm 2006). "Cấu trúc của ribosome 70S phức tạp với mRNA và tRNA". Khoa học. 313 (5795): 1935–42. Bibcode:2006Sci ... 313.1935S. doi:10.1126 / khoa học.1131127. PMID 16959973.
  39. ^ Korostelev A, Trakhanov S, Laurberg M, Noller HF (tháng 9 năm 2006). "Cấu trúc tinh thể của phức hợp 70S ribosome-tRNA cho thấy sự tương tác và sắp xếp lại chức năng". Ô. 126 (6): 1065–77. doi:10.1016 / j.cell.2006.08.032. PMID 16962654.
  40. ^ Yusupova G, Jenner L, Rees B, Moras D, Yusupov M (tháng 11 năm 2006). "Cơ sở cấu trúc cho sự di chuyển RNA thông tin trên ribosome". Thiên nhiên. 444 (7117): 391–4. Bibcode:2006Natur.444..391Y. doi:10.1038 / nature05281. PMID 17051149.
  41. ^ a b "Cấu trúc bên trong chuyên biệt của sinh vật nhân sơ | Vi sinh vật vô biên". Course.lumenlearning.com. Đã lấy 2018-09-27.
  42. ^ Savir Y, Tlusty T (tháng 4 năm 2013). "Ribosome như một bộ giải mã tối ưu: một bài học về nhận dạng phân tử". Ô. 153 (2): 471–9. doi:10.1016 / j.cell.2013.03.032. PMID 23582332.
  43. ^ Korkmaz G, Sanyal S (tháng 9 năm 2017). "Escherichia coli". Tạp chí Hóa học Sinh học. 292 (36): 15134–15142. doi:10.1074 / jbc.M117.785238. PMC 5592688. PMID 28743745.
  44. ^ Konevega AL, Soboleva NG, Makhno VI, Semenkov YP, Wintermeyer W, Rodnina MV, Katunin VI (tháng 1 năm 2004). "Các gốc Purine ở vị trí 37 của tRNA ổn định tương tác codon-đối mã ở vị trí A ribosome bằng cách xếp chồng và tương tác phụ thuộc Mg2 +". RNA. 10 (1): 90–101. doi:10.1261 / rna.5142404. PMC 1370521. PMID 14681588.
  45. ^ Rodnina MV, Beringer M, Wintermeyer W (tháng 1 năm 2007). "Cách ribosome tạo liên kết peptit". Xu hướng trong Khoa học Hóa sinh. 32 (1): 20–6. doi:10.1016 / j.tibs.2006.11.007. PMID 17157507.
  46. ^ Cech TR (tháng 8 năm 2000). "Sinh học cấu trúc. Ribosome là một ribozyme". Khoa học. 289 (5481): 878–9. doi:10.1126 / khoa học.289.5481.878. PMID 10960319.
  47. ^ Banerjee D, Sanyal S (tháng 10 năm 2014). "Hoạt động gấp protein của ribosome (PFAR) - mục tiêu cho các hợp chất antiprion". Vi rút. 6 (10): 3907–24. doi:10.3390 / v6103907. PMC 4213570. PMID 25341659.
  48. ^ Fedorov AN, Baldwin TO (tháng 12 năm 1997). "Sự gấp protein cơ cấu". Tạp chí Hóa học Sinh học. 272 (52): 32715–8. doi:10.1074 / jbc.272.52.32715. PMID 9407040.
  49. ^ Baldwin RL (tháng 6 năm 1975). "Trung gian trong các phản ứng gấp protein và cơ chế gấp protein". Đánh giá hàng năm về Hóa sinh. 44 (1): 453–75. doi:10.1146 / annurev.bi.44.070175.002321. PMID 1094916.
  50. ^ Das D, Das A, Samanta D, Ghosh J, Dasgupta S, Bhattacharya A, Basu A, Sanyal S, Das Gupta C (tháng 8 năm 2008). “Vai trò của ribôxôm trong quá trình gấp protein”. Tạp chí Công nghệ Sinh học. 3 (8): 999–1009. doi:10.1002 / biot.200800098. PMID 18702035.
  51. ^ Dabrowski-Tumanski P, Piejko M, Niewieczerzal S, Stasiak A, Sulkowska JI (tháng 12 năm 2018). "Liên kết protein bằng cách chủ động xâu chuỗi polypeptide ở mũi thoát ra từ kênh thoát Ribosome". Tạp chí Hóa lý B. 122 (49): 11616–11625. doi:10.1021 / acs.jpcb.8b07634. PMID 30198720.
  52. ^ Brandman O, Stewart-Ornstein J, Wong D, Larson A, Williams CC, Li GW, Zhou S, King D, Shen PS, Weibezahn J, Dunn JG, Rouskin S, Inada T, Frost A, Weissman JS (tháng 11 năm 2012) . "Một phức hợp kiểm soát chất lượng liên kết với ribosome kích hoạt sự suy giảm của các peptide sơ khai và căng thẳng dịch tín hiệu". Ô. 151 (5): 1042–54. doi:10.1016 / j.cell.2012.10.044. PMC 3534965. PMID 23178123.
  53. ^ Defenouillère Q, Yao Y, Mouaikel J, Namane A, Galopier A, Decourty L, Doyen A, Malabat C, Saveanu C, Jacquier A, Fromont-Racine M (tháng 3 năm 2013). "Phức hợp liên kết với Cdc48 liên kết với các hạt 60S là cần thiết để loại bỏ các sản phẩm dịch sai". Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 110 (13): 5046–51. Bibcode:2013PNAS..110.5046D. doi:10.1073 / pnas.1221724110. PMC 3612664. PMID 23479637.
  54. ^ Shen PS, Park J, Qin Y, Li X, Parsawar K, Larson MH, Cox J, Cheng Y, Lambowitz AM, Weissman JS, Brandman O, Frost A (Tháng 1 năm 2015). "Tổng hợp protein. Các tiểu đơn vị ribosome Rqc2p và 60S làm trung gian cho sự kéo dài không phụ thuộc vào mRNA của các chuỗi mới sinh". Khoa học. 347 (6217): 75–8. Bibcode:2015Sci ... 347 ... 75S. doi:10.1126 / science.1259724. PMC 4451101. PMID 25554787.
  55. ^ Keeley J, Gutnikoff R (2015-01-02). "Nghiên cứu về ribosome làm bật ra cơ chế tổng hợp protein mới" (Thông cáo báo chí). Viện y tế Howard Hughes. Đã lưu trữ từ bản gốc vào ngày 1 tháng 12 năm 2015. Đã lấy 2015-01-16.
  56. ^ Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P (2002). "Ribosome liên kết màng xác định ER thô". Sinh học phân tử của tế bào (Xuất bản lần thứ 4). New York: Khoa học Garland. ISBN 978-0-8153-4072-0.
  57. ^ a b Noller HF (tháng 4 năm 2012). "Tiến hóa tổng hợp protein từ thế giới RNA". Các quan điểm về cảng mùa xuân lạnh trong sinh học. 4 (4): a003681. doi:10.1101 / cshperspect.a003681. PMC 3312679. PMID 20610545.
  58. ^ Dabbs ER (1986). Nghiên cứu đột biến trên ribosome nhân sơ. New York: Springer-Verlag.
  59. ^ Noller HF, Hoffarth V, Zimniak L (tháng 6 năm 1992). "Sự đề kháng bất thường của peptidyl transferase đối với các quy trình chiết xuất protein". Khoa học. 256 (5062): 1416–9. Bibcode:1992Sci ... 256.1416N. doi:10.1126 / khoa học.1604315. PMID 1604315.
  60. ^ Nomura M, Mizushima S, Ozaki M, Traub P, Lowry CV (1969). "Cấu trúc và chức năng của ribôxôm và các thành phần phân tử của chúng". Chuyên đề Cold Spring Harbor về Sinh học Định lượng. 34: 49–61. doi:10.1101 / sqb.1969.034.01.009. PMID 4909519.
  61. ^ a b Root-Bernstein M, Root-Bernstein R (tháng 2 năm 2015). "Ribosome như một mắt xích còn thiếu trong quá trình tiến hóa của sự sống". Tạp chí Sinh học Lý thuyết. 367: 130–158. doi:10.1016 / j.jtbi.2014.11.025. PMID 25500179.
  62. ^ Yarus M (2002). “Di truyền nguyên sinh: kiểu hình của ribôxôm”. Đánh giá hàng năm về Di truyền học. 36: 125–51. doi:10.1146 / annurev.genet.36.031902.105056. PMID 12429689.
  63. ^ Forterre P, Krupovic M (2012). "Nguồn gốc của Virions và Virocells: Giả thuyết Thoát hiểm được xem xét lại". Virus: Tác nhân cần thiết của sự sống. trang 43–60. doi:10.1007/978-94-007-4899-6_3. ISBN 978-94-007-4898-9.
  64. ^ Caetano-Anollés G, Seufferheld MJ (2013). "Các gốc rễ hệ số của hóa sinh và tổ chức tế bào thách thức mô hình thế giới RNA". Tạp chí Vi sinh phân tử và Công nghệ Sinh học. 23 (1–2): 152–77. doi:10.1159/000346551. PMID 23615203.
  65. ^ Saladino R, Botta G, Pino S, Costanzo G, Di Mauro E (tháng 8 năm 2012). "Di truyền trước hay chuyển hóa trước? Manh mối về formamide". Đánh giá của Hiệp hội Hóa học. 41 (16): 5526–65. doi:10.1039 / c2cs35066a. PMID 22684046.
  66. ^ Fox GE (tháng 9 năm 2010). "Nguồn gốc và sự tiến hóa của Ribosome". Cold Spring Harb Perspect Biol. 2 (9). doi:10.1101 / cshperspect.a003483. PMID 20534711.
  67. ^ Fox GE (2016). "Nguồn gốc và sự tiến hóa ban đầu của ribosome". Trong Hernández G, Jagus R (biên tập). Sự phát triển của máy móc tổng hợp protein và quy định của nó. Thụy Sĩ: Springer, Cham. trang 31–60. ISBN 978-3-319-39468-8.
  68. ^ Shi, Zhen; Fujii, Kotaro; Kovary, Kyle M.; Genuth, Naomi R.; Röst, Hannes L.; Teruel, Mary N.; Barna, Maria (2017). "Ribosome không đồng nhất được ưu tiên dịch các tiểu phân riêng biệt của mRNA trên toàn bộ hệ gen". Tế bào phân tử. Elsevier BV. 67 (1): 71–83.e7. doi:10.1016 / j.molcel.2017.05.021. ISSN 1097-2765.
  69. ^ Xue, Shifeng; Barna, Maria (2012-05-23). "Ribôxôm chuyên biệt: biên giới mới trong quy định gen và sinh học sinh vật". Đánh giá bản chất sinh học tế bào phân tử. Springer Science and Business Media LLC. 13 (6): 355–369. doi:10.1038 / nrm3359. ISSN 1471-0072. PMC 4039366.
  70. ^ Ferretti, Max B.; Karbstein, Katrin (2019-02-07). "Sự chuyên môn hóa chức năng của ribosome có thực sự tồn tại không?". RNA. Phòng thí nghiệm Cold Spring Harbor. 25 (5): 521–538. doi:10.1261 / rna.069823.118. ISSN 1355-8382.
  71. ^ Farley-Barnes, Katherine I .; Ogawa, Lisa M.; Baserga, Susan J. (2019). "Ribosomopathies: Những khái niệm cũ, những tranh cãi mới". Xu hướng di truyền. Elsevier BV. 35 (10): 754–767. doi:10.1016 / j.tig.2019.07.004. ISSN 0168-9525.
  72. ^ Mauro VP, Edelman GM (tháng 9 năm 2002). "Giả thuyết bộ lọc ribosome". Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 99 (19): 12031–6. Bibcode:2002PNAS ... 9912031M. doi:10.1073 / pnas.192442499. PMC 129393. PMID 12221294.
  73. ^ Xue S, Barna M (tháng 5 năm 2012). "Các ribosome chuyên biệt: một biên giới mới trong quy định gen và sinh học sinh vật". Đánh giá bản chất. Sinh học tế bào phân tử. 13 (6): 355–69. doi:10.1038 / nrm3359. PMC 4039366. PMID 22617470.
  74. ^ Mathis AD, Naylor BC, Carson RH, Evans E, Harwell J, Knecht J, Hexem E, Peelor ​​FF, Miller BF, Hamilton KL, Transtrum MK, Bikman BT, Price JC (tháng 2 năm 2017). "Cơ chế thay đổi quá trình bảo trì Ribosome của In Vivo để đáp ứng các tín hiệu dinh dưỡng". Phân tử & Proteomics tế bào. 16 (2): 243–254. doi:10.1074 / mcp.M116.063255. PMC 5294211. PMID 27932527.
  75. ^ Steffen, Kristan K.; McCormick, Mark A. .; Pham, Kim M.; MacKay, Vivian L.; Delaney, Joe R.; Murakami, Christopher J.; Kaeberlein, Matt; Kennedy, Brian K. (2012-02-29). "Sự thiếu hụt Ribosome bảo vệ chống lại stress ER ở Saccharomyces cerevisiae". Di truyền học. Hiệp hội Di truyền học Hoa Kỳ. 191 (1): 107–118. doi:10.1534 / genetics.111.136549. ISSN 0016-6731. PMC 3338253.
  76. ^ Lee SW, Berger SJ, Martinović S, Pasa-Tolić L, Anderson GA, Shen Y, Zhao R, Smith RD (tháng 4 năm 2002). "Phân tích khối phổ trực tiếp các protein nguyên vẹn của tiểu đơn vị ribosom lớn của nấm men sử dụng LC / FTICR mao quản". Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 99 (9): 5942–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.5942L. doi:10.1073 / pnas.082119899. PMC 122881. PMID 11983894.
  77. ^ Carroll AJ, Heazlewood JL, Ito J, Millar AH (tháng 2 năm 2008). "Analysis of the Arabidopsis cytosolic ribosome proteome provides detailed insights into its components and their post-translational modification". Phân tử & Proteomics tế bào. 7 (2): 347–69. doi:10.1074/mcp.m700052-mcp200. PMID 17934214.
  78. ^ Odintsova TI, Müller EC, Ivanov AV, Egorov TA, Bienert R, Vladimirov SN, Kostka S, Otto A, Wittmann-Liebold B, Karpova GG (tháng 4 năm 2003). "Characterization and analysis of posttranslational modifications of the human large cytoplasmic ribosomal subunit proteins by mass spectrometry and Edman sequencing". Journal of Protein Chemistry. 22 (3): 249–58. doi:10.1023/a:1025068419698. PMID 12962325.
  79. ^ Yu Y, Ji H, Doudna JA, Leary JA (June 2005). "Mass spectrometric analysis of the human 40S ribosomal subunit: native and HCV IRES-bound complexes". Khoa học Protein. 14 (6): 1438–46. doi:10.1110/ps.041293005. PMC 2253395. PMID 15883184.
  80. ^ Zeidan Q, Wang Z, De Maio A, Hart GW (June 2010). "O-GlcNAc cycling enzymes associate with the translational machinery and modify core ribosomal proteins". Sinh học phân tử của tế bào. 21 (12): 1922–36. doi:10.1091/mbc.e09-11-0941. PMC 2883937. PMID 20410138.
  81. ^ Landry DM, Hertz MI, Thompson SR (December 2009). "RPS25 is essential for translation initiation by the Dicistroviridae and hepatitis C viral IRESs". Gen & Phát triển. 23 (23): 2753–64. doi:10.1101/gad.1832209. PMC 2788332. PMID 19952110.
  82. ^ Decatur WA, Fournier MJ (July 2002). "rRNA modifications and ribosome function". Xu hướng trong Khoa học Hóa sinh. 27 (7): 344–51. doi:10.1016/s0968-0004(02)02109-6. PMID 12114023.
  83. ^ Natchiar SK, Myasnikov AG, Kratzat H, Hazemann I, Klaholz BP (November 2017). "Visualization of chemical modifications in the human 80S ribosome structure". Thiên nhiên. 551 (7681): 472–477. Bibcode:2017Natur.551..472N. doi:10.1038/nature24482. PMID 29143818.
  84. ^ Guo H (August 2018). "Specialized ribosomes and the control of translation". Giao dịch xã hội sinh hóa. 46 (4): 855–869. doi:10.1042/BST20160426. PMID 29986937.

liện kết ngoại